Di Tahun Pelajaran 2023-2024 SMPN 41 Kota Bekasi terpilih sebagai sekolah binaan Kampanye Sekolah Sehat (KSS). KSS ini berfokus pada 3S, yaitu: Sehat Bergizi, Sehat Fisik dan Sehat Imunisasi.
Berikut ini beberapa kegiatan KSS yang dilakukan segenap keluarga besar SMPN 41 Kota Bekasi;
Sehat bergizi:
1. Makan sehat bersama setiap Hari Rabu
2. Selalu membawa bekal sehat dan tumbler
3. Mengurangi penggunaan plastik dan styrofoam ketika jajan ke kantin
4. Minum tablet tambah darah
Sehat Fisik:
1. Jalan kaki menuju sekolah
2. Olahraga bersama setiap Rabu
3. Melakukan PROT (Permainan Rakyat dan Olahraga Tradisional)